В начале 20 века на месте с. Мухино была д. Касаткино. Купец Мухин начал обучать детей письму и счёту. Позднее при помощи других приезжих купцов была организована школа для взрослых. С построением тёплой церкви, при ней открылась церковно – приходская школа.
Это был 1850 год. Он считается годом основания школы.
В начале XX века в селе уже было три школы: церковно – приходская для девочек, церковно – приходская для мальчиков и двуклассное училище Министерства народного просвещения.
В 1931 году в с. Мухино была открыта первая семилетняя школа.
С 1941 по 1944 год при школе был дошкольный интернат для эвакуированных детей из Ленинграда.
В 1947 году школа стала средней единственной в Мухинском районе. Наполняемость классов превышала 30 человек. Под школу использовалось приспособленное здание церкви.
1975 год – долгожданное новоселье. К приспособленному старому пристроено кирпичное здание новой школы.
В 2005 году у школы появляется филиал НОШ в с.Рябово.